少林寺屠狮大会之后，张无忌中了朱元璋奸计，将明教教主之位传给杨逍之后，便不辞而别。当时，明教各部的反元义军声势已成，杨逍功微德薄难以服众，继任教主不到一年，各地义军便纷纷各自称王，脱离明教管辖。明教名存实亡。
独立为王的各方势力之中，以朱元璋一支声势最盛。之后，又经过多年征战，朱元璋率领将士，将从明教独立出来的陈友谅，张士诚，方国珍等部逐个消灭，最后攻破元大都，将元人逐出长城，建立大明王朝。
定国之后，朱元璋疑心渐重，唯恐他人得知自己逼走张无忌的旧事。为了掩盖此事，朱元璋以谋反为名诛杀胡惟庸，蓝玉等人，并借题发挥，将昔日的明教旧部一网打尽。又设下锦衣卫，东厂西厂等监察机构，在上监视文武百官，在下网罗江湖高手，妄图控制武林群豪。
正当朱元璋全力铲除异己之时，江湖中却有人以重建明教、替天行道为名，四处招揽天下高手......
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